个人简介 Personal Profile

文波，男，1975年生，遗传学博士，国家重大科学研究计划（973）首席科学家，牛博平台基础医学院院长，医学表观遗传中心主任。主要从事人类遗传学及表观遗传学相关领域的研究，发表学术论文48篇，被引用>7500次。其中，作为第一或通讯作者在Nature、Nature Genetics、Molecular Cell、Genome Research等期刊发表研究型论文20余篇。近五年来，课题组围绕“染色质高级结构的功能及分子机制”这一前沿科学问题进行研究，以核基质（Nuclear Matrix）、核体（Nuclear Bodies）等细胞核超微环境为切入点，揭示了多个新的染色质高级结构调控分子及作用机制。近五年主持国家重大科学研究计划、国家基金委重点项目等国家级科研项目4项，总经费超过3400万元；担任科技部重点研发计划指南编制专家、综合绩效评估专家，担任Cell, Nature Cell Biology, Molecular Cell等一流期刊审稿人。

工作经历

2023.07 至今  牛博平台基础医学院院长

2017 至 2023  复旦大学基础医学院研究员

2010 至 2017  复旦大学生物医学研究院研究员

2009 至 2010  美国霍普金斯大学医学系讲师

2005 至 2009  美国霍普金斯大学医学系博士后

教育经历

2000 至 2004  复旦大学遗传所，博士，导师：金力

1997 至 2000  云南大学生物系 硕士，导师：肖春杰

1993 至 1997  云南大学生物系 学士

研究方向 Research Interests

重大疾病（如神经退行性疾病等）染色质稳态失衡的机制及转化

实验室科研项目 Projects

在研科研项目

（1）2022.1-2026.12国自然重点项目：“核基质蛋白对染色质高级结构的调控功能及机制研究”,283万元，负责人

（2）2022.1-2026.12科技部重点研发计划：“干细胞命运决定过程中胞核内无膜颗粒结构的调控功能和分子机制”,635万元，子课题负责人

已结题项目

（1）2015.1-2019.8国家重大科学研究计划（S-973）：“长非编码RNA在精子发生中的功能及机制”，2500万元，首席科学家

（2）2014.1-2017.12国自然面上项目：“小鼠胚胎干细胞定向分化中异染色质域与核纤层的相互作用”，90万元，负责人

（3）2018.1-2021.12国自然面上项目:“核基质相关长非编码RNA NMALT1对肝脏脂代谢及三维基因组的调控作用及机制研究”，60万元，负责人

（4）2018.12-2021.12重点研发计划项目：“精子发生的调节机制”，163万元，学术骨干

（5）2011.1-2015.12973计划重大科学问题导向项目：“非编码RNA在干细胞命运调控中的功能及分子机制”，230万元，学术骨干

（6）2011.1-2013.12国家基金委重大研究计划/培育项目：“胚胎干细胞定向分化中大片段异染色质修饰的全基因组动态及"上锁"假说”，60万元，负责人

团队介绍 Research Team

代表性科研论文 Publications

( *：co-corresponding authors 共同通讯作者; #：co-first authors 共同第一作者)

1.Huo X, Ji L, Zhang Y, Lv P, Cao X, Wang Q, Yan Z, Dong S, Du D, Zhang F, Wei G, Liu Y, Wen B*. The Nuclear Matrix Protein SAFB Cooperates with Major Satellite RNAs to Stabilize Heterochromatin Architecture Partially through Phase Separation. Molecular Cell. 2020 Jan 16;77(2):368-383.

2.Fan H#, Lv P#, Huo X, Wu J, Wang Q, Cheng L, Liu Y, Tang QQ, Zhang L, Zhang F, Zheng X, Wu H, Wen B*. The nuclear matrix protein HNRNPU maintains 3D genome architecture globally in mouse hepatocytes. Genome Research. 2018 Feb;28(2):192-202.

3.Zhang Y#, Cao X#, Gao Z#, Ma X#, Wang Q, Xu X, Cai X, Zhang Y, Zhang Z, Wei G*,

Wen B*. MATR3-antisense LINE1 RNA meshwork scaffolds higher-order chromatin

organization. EMBO Rep. 2023 Aug 3;24(8):e57550.

4.Ming H#, Wang Q#, Zhang Y, Ji L, Cheng L, Huo X, Yan Z, Dang Y and Wen B*. The nuclear bodies formed by histone demethylase KDM7A. Protein & Cell. 2021 Apr;12(4):297-304.

5.Wang Y#, Hong Q, Xia Y#, Zhang Z*, Wen B*. The Lysine Demethylase KDM7A Regulates Immediate Early Genes in Neurons. Advanced Science. 2023 Aug: 10(28):e2301367.

6.Sun Z#, Zhu M#, Lv P, Cheng L, Wang Q, Tian P, Yan Z, Wen B*. The Long Noncoding RNA Lncenc1 Maintains Naive States of Mouse ESCs by Promoting the Glycolysis Pathway. Stem Cell Reports. 2018. 11(3):741-755.

7.Hu S#, Lv P#, Yan Z, Wen B*. Disruption of nuclear speckles reduces chromatin interactions in active compartments. Epigenetics & Chromatin. 2019 Jul 17;12(1):43.

8.Wen B, Wu H, Shinkai Y, Irizarry R and Feinberg AP*. Large histone H3 lysine-9 dimethylated chromatin blocks distinguish differentiated from embryonic stem cells. Nature Genetics. 2009. 41: 246-50 (Cover story).

9.Doi A#, Park IH#, Wen B#, Murakami P, Aryee M, Irizarry R, Herb B, Ladd-Acosta C, Rho J, Loewer S, Miller J, Schlaeger T, Daley GQ and Feinberg AP*. Differential methylation of tissue- and cancer specific CpG island shores distinguishes human induced pluripotent stem cells, embryonic stem cells and fibroblasts. Nature Genetics. 2009 41(12):1350-3.

10.Wen B, Li H, Lu DR, Song XF, Zhang F, He YG, Li F, Gao Y, Mao XY, Zhang L, Qian J, Tan JZ, Huang W, Deka R, Su B, Chakraborty R, Jin L. Genetic Evidence Supports Demic Diffusion of Han Culture. Nature. 2004. 431: 302-5.